深圳（南山）中加学校是一所中外合作全住读式、实施普通高中教育的新型学校。由深圳市南山区教育科学研究中心与加拿大纽宾士域省政府教育部及加拿大加皇国际教育集团共同创办。2001年2月13日加拿大克雷蒂安总理访华期间正式签署合办协议，加拿大纽宾士域省教育部领导、深圳市南山区领导与我校领导出席了签字仪式。
学校实行理事会领导下的校长负责制。理事长由联合国教科文组（UNESCO）亚太名誉理事彭建华博士担任；学校法人校长由全国高级中学委员会理事长、北京市模范校长、原北京师范大学附属实验中学校长王本中先生出任；加拿大纽宾士域省政府教育部选派的资深教育专家 VERNON GOOD FELLOW 先生出任加方校长并参与制定学校课程和学校管理。
深圳（南山）中加学校学生实行双学籍、双学制管理，即中国学籍及加拿大学籍，课程执行中国教学大纲及加拿大学分制课程。学生学习期间可参加赴加拿大交流学习。学生高中修满学分，成绩合格者可获得中国的高中毕业证书和加拿大纽宾士域省政府教育部颁发的高中毕业证书（等同于加拿大本土的高中毕业生学历资格）。获得双学历证书的学生可在中国报考大学，也同时具备了申请加拿大等英语国家攻读大学的资格，成绩优良者可以申请到加拿大大学的奖学金。我校毕业生还可以选择升入北京中加学校的加拿大高中后教育班，专业分别为工商管理与科技（BTM）班、工商管理和电脑科学学士（BBA、BSC）基础班、信息管理学士（BCIS）班和国际五星级旅游管理专业（IHM）班，申请时享有优先录取权。
学校拥有一支中、外结合的骨干教师队伍。中方任课教师来自于全国招聘的优秀教师，其中包括特级教师、学科带头人、高级教师等一批有影响的知名教师。外籍副校长和外籍教师由加拿大纽宾士域省教育部选派。外籍副校长负责学生的加拿大学籍和课程的管理及加拿大高中毕业证书的签发。
深圳（南山）中加学校是北京中加学校成功的延伸和发展，学校坚持高起点建校、高质量办学、高水平管理，为促进每一个学生的发展提供中、外优质教育。学校环境优美，配有先进的教育教学、生活设施，拥有中外藏书的图书馆，电脑语音教室，多媒体教室，理、化、生实验室，音体美专用教室等，设备达到国际先进水平。 学生宿舍实行公寓式管理，每个房间配有独立浴室、卫生间和空调等生活设施。学校管理完善，创造了新型学校教学管理和生活服务的新模式。