广州市第十六中学于1934年建校，原名为广州培桂中学，由知名教育家马君武（创办广西大学）任首任校长。 马君武先生致力于人才 培养，与蔡元培先生有"北蔡南马"之称。周恩来评价他是"一代宗师"。1949年，又推举著名语言学大师王力为董事长，现用"广州市 第十六中学"校名为王力先生亲题
学校于1993年被评为广东省首批省一级学校，2007年通过广东省国家级示范高中确认验收，同时被评为广东省高中教学水平优秀等级 学校。在创建过程中，投入大量资金对校园重新规划改造,同时更新和补充教学仪器设备，加强教育信息化建设，按示范性高中的标准配 置专用功能场室，使学校的办学条件得到了全面提升。学校有200米环形跑道（附设130米直跑道）运动场、室内体育馆、室内乒乓球馆各 1个，篮球场5个，排球场1个，羽毛球场4个。现已建成符合高考、中考要求的语音室三间，2011年3月和5月开始，分别承担全国普通高考 和广州市中考英语听说考场工作。建有1000M主干校园网，教育教学信息资源库，现代办公管理系统，所有教室、实验室和学科功能室均 配有多媒体计算机教学平台。今日十六中，校园内古树参天，绿树成荫，环境幽雅，文化氛围浓郁，设备设施完善，是读书育人的好地方。
在七十九年办学历程中，十六中人始终坚守理想，在建校之初即以"勤朴诚悫"为校训，而今十六中人秉承"校风正，师资高，学绩 优"的传统，以育人为中心，走内涵发展道路，不断强化人才培养质量意识，成为一所质量高、校风正、有特色的现代化学校，入选广东 百所名校，成为莘莘学子成才的摇篮。
十六中在"以学生发展为本，为学生可持续发展奠基"的办学理念引领下发展，实施"自主学习、自我教育、自求发展"的"三自" 教育模式，全面提高学生素质，为学生全面发展和个性发展创设条件和空间。学生学习基础扎实，品德行为良好。教师敬业爱生，师德高 尚。十六中有一支优秀的教师队伍，其中特级教师1人，高级教师90人，有研究生学历的教师89人。先后有406人次分别获得全国先进劳动 者、全国模范教师、广东省五一劳动奖章、广东省优秀班主任、南粤优秀教师、南粤教书育人优秀教师、南粤教坛新秀、广州市劳动模范、 广州市三八红旗手、广州市记二等功、广州市优秀共产党员等全国、省、市、区级各类荣誉称号。